De Stichting heeft een faciliterende, initiërende en coördinerende rol in samenwerking met de bij haar aangesloten afdelingen van de Vrijzinnige Geloofsgemeenschap NPB en kerkelijke gemeenten in het gebied waarover deze afdelingen en gemeenten zich uitstrekken.¬
Meer uitgewerkt wil dat zeggen dat de Stichting op de achtergrond altijd aanwezig is, zo de continuïteit bewaakt en waar nodig bestuurlijk ondersteunt door het aanbieden van haar deskundigheid (b.v. financiële) en ervaringen op verschillende terreinen.
Traditioneel vervult de Stichting een aantal taken, voortvloeiend uit de statuten.

De Stichting wordt bestuurd door het Algemeen Bestuur (AB). Iedere afdeling heeft hier een vertegenwoordiger in. Uit dit AB worden in principe de leden voor het Dagelijks Bestuur (DB) gekozen.
Het DB is belast met de dagelijkse leiding en met de voorbereiding van de zaken die in het AB aan de orde komen en met de uitvoering van de door dat Bestuur genomen besluiten."(statuten art. 12 lid I)
In de praktijk en in het algemeen komt dit neer op het behartigen van de voortgang en coördinatie van alle lopende zaken.
Meer specifiek is de aandacht van het DB ten aanzien van het AB gericht op voorbereiding van het overleg, oriëntatie en verdieping, bevorderen van uitwisseling tussen de leden, het afleggen van rekening en verantwoording (jaarverslagen, begrotingen, beheer), enz.